荧光定量pcr是目前分子生物学研究中常使用的技术手段之一,但很多初学者在做荧光定量pcr实验时都会遇到一些问题,为了更好地指导研究生的实验教学,结合我们实验室的经验,特将qpcr 常见问题及解决方案总结如下:
①扩增曲线不稳定
可能原因:rna 纯度低;体系中存在较多杂质;仪器使用时间过长。
解决方案:
提取高纯度的 rna,小心操作;
对仪器进行校准;
②扩增无法达到平台期
可能原因:模板浓度太低;循环数太少;试剂扩增效率低。
解决方案:
提高模板量;
提高循环数;
用标准曲线测定扩增效率,提高镁离子浓度,换用扩增效率高的试剂。
③荧光下降
可能原因:存在降解;模板浓度过高。
解决方案:
提高体系纯度;
降低模板量;
降低荧光阈值。
④单峰,峰不尖锐
可能原因:与试剂成分有关;或存在大小相近的非特异性扩增。
解决方案:
温度跨度不高于 7 度,视为可用结果;
进行高浓度琼脂糖电泳,确认是否为单一条带。
⑤单峰,tm 低于 80 度
可能原因:只有引物二聚体,无目的条带;或扩增片段过短。
解决方案:
检查是否加入模板;
进行琼脂糖电泳检测,确定条带大小是否正确。
⑥双峰,较低峰 tm 在 80 度之前
可能原因:由于模板浓度过低或引物浓度过高使多余引物形成引物二聚体。
解决方案:
适当提高退火温度;
提高模板量,降低引物浓度;
重新设计引物。
⑦严重双峰,tm 都在 80 度以后
可能原因:引物特异性过差或交叉污染。
解决方案:
blast 检查引物特异性,重新设计引物;
在超净台中,换用移液器分别加入引物,避免交叉污染。
⑧其他非正常熔解曲线
可能原因:应体系污染、试剂失效;耗材与仪器不匹配,检测通道不正确;仪器长时间未做矫正。
解决方案:
在无模板洁净区内配制体系;
避免将试剂暴露在强光或高温下;
避免试剂过期;
做好阳性、阴性对照;
选用与仪器匹配的耗材;
定期请工程师进行仪器校准。
⑨标准曲线线性关系不佳
可能原因:加样误差;标准品降解;模板浓度高或有抑制物;引物或探针不佳;pcr 酶灵敏度不高及活力下降。
解决方案:
标准品加样体积大于 2ul、引物预混后再分复孔,定期校正移液器,尽量选择硅化枪头,使用文库稀释液稀释标准品,降低耗材管壁对 dna 吸附;
避免反复冻融、电泳检测发现降解后重新制备稀释标准品;
改变稀释精度,增加稀释梯度;
更换灵敏度更高,线性关系更好的试剂,校正-20℃冰箱,使用时将酶置于冰上。
义翘神州提供实时荧光定量pcr技术服务,其优势:
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②通过qpcr技术完成定量分析、相对定量分析或jue对定量分析。
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