什么是CUT&Tag技术?

近年基因组学和表观遗传学领域引入了两种新方法:
核酸酶靶向切割和释放技术(cut&run)
靶向剪切及转座酶技术(cut&tag)
cut&run和cut&tag检测法正在取代chip-seq
简化的工作流程跳过了chip-seq实验法中的挑战性步骤,包括染色质片段化和抗体pull down,用更少的细胞和测序读数得到更佳的数据。
具体变现为:
1.低细胞需求量;
2.高吞吐量;
3.操作流程更简易;
4.低成本,测序读取次数更少;
5.数据质量可靠,重复性好
epicypher cut&tag:
孵育结合好特异性抗体与靶标蛋白后,加入蛋白 a、蛋白g与tn5的复合物(pag-tn5),使得转座体进入细胞并与抗体结合,间接地固定在靶蛋白上;激活tn5酶的切割活性,将靶蛋白结合的dna区域切断,从而达到提取dna、进行pcr扩增、构建文库的目的。在tn5上融合了protein a/g抗体结合功能域的转座体pag-tn5是关键的进步,因为这一步允许研究者不必碎裂染色质以及进行传统的库准备步骤。
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