Takara真香*—简便好用的液态活检解决方案之游离DNA篇
在肿瘤早期筛查研究领域，循环肿瘤dna（ctdna）一直是各大厂商、科研工作者关注的重点。虽然ctdna的应用日趋成熟，但总有一些微量的ctdna样本无法用传统技术完成高品质文库的构建，特别是在进行肿瘤早期诊断有重要价值的稀有突变分析时。
如何以微量ctdna起始构建可准确分析稀有突变的文库？takara的解决方案是引入分子标签技术！
■ 微量ctdna样本无法准确分析稀有变异? 自带1600万分子标签的建库技术了解一下
thruplex tag-seq kit是takara推出的采用茎环形接头，含1600万种分子标签的dna-seq文库构建技术，足以准确区分是测序错误还是真实的稀有突变！
同时，该产品支持1-50 ng cfdna起始，微量样本的文库构建不再是难题！
thruplex单管操作、手动15 min、总共两小时，过程中无需转管与纯化，实验小白也能轻松上手！
● 实验案例
分别以10 ng及30 ng的cfdna标准样品（horizon diagnostics）起始，使用thruplex tag-seq kit制备文库，然后使用agilent sureselect靶向序列富集系统定制panel(110 kb)，或roche的nimblegen seqcap ez定制panel（240 kb）进行富集，使用illumina的ngs平台进行测序。得到的数据使用curio（curio genomics）分析。
使用agilent (30 ng dna input)或roche（10 ng dna input）两者中的任意一个靶向富集系统时，可以得到与已知的maf（minor allele frequency）同等的结果。
（数据来源于takara bio usa, inc.）
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● 实验友好型的ctdna稀有突变分析方案
可能有些刚开展ctdna稀有变异分析项目的朋友会有所担心，即便能简便快捷地构建ngs文库，但后期如果没有易用的生信分析流程，一样会成为项目研发的阻碍。
no worries！以下三款生信分析工具，搭配thruplex tag-seq使用，效果更佳！
connor：github平台上一款开放型的生信工具，可以处理thruplex tag-seq文库的测序数据。connor可以aligned bam文件作为输入量，分析分子标签信息，并生成含对应序列的bam文件，后续可结合突变分析软件进行分析，如freebayes等。
curio：curio genomics公司所推出的基于“云”的生信平台，thruplex tag-seq文库的测序数据可以上传、处理及可视化。该平台运行速度快，用户界面友好，具有强大的alignment viewer。同时，curio整合了变异检测、分析及可视化的模块，方便用户使用。
strand ngs：由strand life sciences推出的原生支持thruplex tag-seq数据分析的生信平台，提供ngs数据的分析、管理及可视化。
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