组织/细胞rna提取指南,摆脱选择综合征!
核糖核酸(rna),存在于生物细胞以及部分病毒、类病毒中的遗传信息载体。rna的碱基主要有4种,即a(腺嘌呤)、g(鸟嘌呤)、c(胞嘧啶)、u(尿嘧啶),其中,u(尿嘧啶)取代了dna中的t(胸腺嘧啶)。核糖核酸在体内的作用主要是引导蛋白质的合成。
图1.dna和rna的结构
rna的分类人体一个细胞含rna约10pg(含dna约7pg)。在细胞中,根据结构功能的不同,rna主要分三类,即trna(转运rna),rrna(核糖体rna),mrna(信使rna)。mrna含量低,占细胞总rna的1%~5%。核糖体rna特点含量高,占细胞总rna的80%~85%。
表1:rna的结构和功能
特殊rna随着高通量组学技术的应用,在高等哺乳动物中已发现高达数十万种非编码rna,根据结构与功能可对其进行科学分类和系统命名,如trna、rrna、snrna、snorna、sirna、mirna、pirna和lncrna等。非编码rna是当今生命科学发展最为迅速的前沿领域之一,它不断更新人们对生命本质的认识,为生物遗传育种及人类重大疾病的干预、防治和药物研究等提供全新的思路与技术(amaral et al,2008)。
图2.非编码rna的生物学功能(cell. 2019 nov 14; 179(5): 1033–1055.)
rna研究的第一步为rna提取,高质量的rna是进行转录组测序、rt-pcr等试验的基础,然而由于rna单链结构的不稳定性和无处不在的rna酶,使得rna在提取过程中容易发生降解,同时,传统的rna提取方法毒性大,因此,提取出高质量的rna,选择合适的提取产品非常重要!
动物组织细胞rna提取
对于常规的新鲜或冻存的组织、贴壁细胞、悬浮细胞rna提取,我们molpure® cell/tissue total rna kit 细胞/组织总rna提取试剂盒19221es,适用于10-20 mg动物组织或(1-5)×106个动物细胞的总rna提取纯化。
产品特点rna纯度高:配有基因组dna吸附柱,可有效去除dna污染;
安 全:无需有毒的酚、氯仿等有机物抽提;
快速简便:无需异丙醇或乙醇沉淀操,操作过程30 min完成;
使用方便:全流程室温操作,无需冰浴和低温离心。
产品性能取106个杂交瘤细胞,分别使用19221和trizol(货号:10606es)提取总rna。之后测定浓度和琼脂糖凝胶电泳;同时取2 μl,使用hifair®ⅲ one step rt-qpcr sybr green kit(货号:11143es)进行定量测试小鼠gapdh。结果显示,molpure®cell/tissue rna kit能稳定提取rna,rna产量高,完整度较好。
图 2.rna 质量和浓度
图3.一步法反转录定量结果 (注:绿色为 19221,蓝色为 trizol)
老师们可能会疑问为什么不trizol或trizol相关的产品呢?因为trizol有它固有的缺点:
有难闻的刺鼻气味
提取过程用到的酚、氯仿都为有毒有机物
提取时间长
如果老师们从成本的角度考虑,我们也有性能优异的trizol提取产品。
molpure®trieasy plus total rna kit总 rna 提取试剂盒(带离心柱)19211es是利用molpure®rna column a1和改进的异硫氰酸胍/酚一步法(trizol法)来提取样品中的总rna,适用于trizol法所能提取的所有样本,包括各种动植物、细菌和细胞样品。该试剂盒方便快捷,1 h完成可完成操作,且不需要异丙醇沉淀和乙醇洗涤过程。
产品特点适用范围广:可通用动物、植物、细菌、细胞等样品
使用方便:“trizol+离心柱”形式,易于操作
快速简便:操作过程1 h完成
产品性能
取6×105左右个293t细胞,分别使用19211es和竞品提取总rna。之后测定浓度和琼脂糖凝胶电泳;结果显示,molpure®trieasy plus total rna kit 19211es能稳定提取rna,rna产量高,纯度和完整度较好。
图 4.rna 质量和浓度
trieasy™ total rna extraction reagent trieasy™ 总rna提取试剂 10606es是一种适用于各种动植物、细菌组织、细胞的总rna抽提试剂,具有的裂解能力,并有效抑制样本中rna的降解,保持rna的完整性。
trieasy™ ls total rna extraction reagent 液体总rna提取试剂(同trizol ls)19201es是一种适用于各种动植物、酵母、细菌等液体样本的总rna抽提试剂,具有的裂解能力,并有效抑制样本中rna的降解,保持rna的完整性。
molpure® cell/tissue mirna kit细胞/组织mirna提取试剂盒 19331es适用于trizol法所能提取的所有样本,包括各种动植物、细菌组织和培养细胞中总rna、mirna和其他各种小rna的提取。该试剂盒可选择提取包含mirna的总rna,或只针对microrna富集,不包含>200 nt其它rna,30min可完成单样本的提取。
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