蛋白八聚体由组蛋白h2a、h2b、h3和h4的各两个亚基组成,由dna包裹形成核小体。组蛋白亚基的n末端含有可进行翻译后修饰的残基。h3上的赖氨酸残基k4可以单、二或三甲基化,分别形成h3k4me1、h3k4me2或h3k4me3。h3k4me1、h3k4me2和h3k4me3位于整个基因组的不同区域。h3k4me1修饰主要分布在活性增强子元件中;h3k4me2修饰主要分布在转录活跃基因的gene body区;而h3k4me3修饰主要分布在tss附近的启动子区并激活转录。
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图片来源:pmid: 30616667
关于h3k4me1
h3k4me1是组蛋白h3蛋白的第4个赖氨酸残基处的单甲基化,通常与基因增强子相关。h3k4me1富集在活性和primed增强子区域内。增强子由组蛋白h3k4单/二甲基转移酶mll4引发,然后由组蛋白h3k27乙酰转移酶p300激活。h3k4me1会微调增强子的活性和功能,而不是控制。具有mll3/4的h3k4me1也可以作用于启动子并抑制基因。h3k4me1修饰是真核细胞增强子的表观遗传学标记,可用于增强子在基因组上定位。
epicypher h3k4me1抗体
epicypher在cut&run和cut&tag实验中筛选了数百种抗体,并通过独-有的snap-certification技术进行验证,为研究者提供了可识别经过修饰的组蛋白和相关细胞靶点的组蛋白ptm抗体。h3k4me1抗体是epicypher最新推出的snap-certified™抗体之一,符合cut&run和cut&tag应用中特异性和有效靶标富集的标准。
产品详情
产品货号
13-0057
产品名称
h3k4me1 antibody, snap-certified™ for cut&run and cut&tag
规格
100 µg
产品类型
monoclonal [2088-1f4]
宿主
rabbit
浓度
0.5 mg/ml
反应种属
human, wide range(predicted)
实验应用
cut&run, cut&tag
免疫原
a synthetic peptide corresponding to histone h3 monomethylated at lysine 4
保存温度
stable for 1 year at 4°c from date of receipt
配方
antigen affinity-purified antibody in borate buffered saline ph 8.0, 0.09% sodium azide
建议稀释度
0.5 µg per reaction for cut&run and cut&tag
实例分析
图1.cut&run中snap特异性分析
图2.cut&tag中snap特异性分析
使用snap-cutana™ k-metstat panel对h3k4me1抗体进行分析,其与相关组蛋白ptms的交叉反应性<20%。
图3.cut&run和cut&tag全基因组富集
h3k4me1抗体和h3k4me3阳性对照产生预期的富集效果,不同数量细胞核的结果保持一致。
500k和50k k562细胞cut&run峰图
图4.h3k4me1抗体cut&run和cut&tag峰图
h3k4me1抗体在cut&run和cut&tag应用中符合epicypher特定批次snap-certified™标准,并且不同的细胞数量下,一致的基因组富集证实了高靶向效率。
关于epicypher
epicypher是一家成立于2012年的表观遗传学公司。从专有组蛋白肽阵列平台epigold™开始,epicypher开发了一系列同类产品。同时,epicypher是重组核小体制造和开发的全球领-导-者。利用其独-有技术,不断添加高纯度修饰重组核小体(dnucs™)产品。dnuc™多样性的产品为破译组蛋白编码和加速药物开发提供了强大的工具。
epicypher还将dnuc™技术广泛的应用于多种分析测定产品中,包括:snap-chip®spike-in controls(用于抗体分析和chip定量), epidyne®底物(用于染色质重塑和抑制剂筛选及开发),dcyher™测定(用于探究表观遗传蛋白质-组蛋白ptm结合相互作用)。最近,epicypher还推出了针对chic、cut&run和cut&tag的高灵敏度表观基因组图谱cutana™分析。
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