用qPCR检测支原体,这3个关键点要注意!

实时定量聚合酶链式反应(qpcr)是一种高灵敏度、高精确度的分子生物学技术,用于检测和量化dna或rna的数量。该项技术已经广泛用于生物相关行业的检测项目中,其中就包括支原体检测。
我们都知道,支原体污染对于细胞相关的临床项目危害巨大,支原体检测是项目申报的必要环节。实现检测的高灵敏度、高特异性,并尽可能缩短实验时间,是非常有意义的。
药典方法中,培养法和指示细胞法都各有缺点,而qpcr方法兼顾了二者的优点,受到众多从业人员的青睐。那么在实验过程中,有哪些注意事项?本期内容,以德国minerva biolabs公司生产的venor gem qep为例,盘点qpcr检测支原体的关键点。
venor gem qep试剂盒能检测多种支原体、灵敏度高、遵循欧洲药典流程要求。
part.01样品处理
一般来说,该试剂盒适用于细胞、细胞培养上清等物质的支原体检测。
当细胞长至80%-90%时,收集样品。此时可对样品进行95℃的孵育处理。
需要注意的是:细胞培养产物中可能存在pcr抑制物质,例如:细胞颗粒、较大的样品体积或其他生物材料(疫苗、石蜡包埋样品等)、胎牛血清含量>5%等情况,需要在进行pcr之前,对样品进行dna提取处理,以尽可能减轻无关因素对实验结果的干扰。
这里推荐试用配套的德国mb支原体提取试剂盒:
有小伙伴可能会产生疑问:培养基中的青霉素或者链霉素,会不会对实验结果产生影响?
就目前有记录的研究结果而言,没有发现常用的“双抗”会对检测的灵敏度等造成影响。
part.02反应体系建立
在进行支原体qpcr检测时,需要设置合适的反应体系和条件。反应体系包括mix、样品dna、缓冲液、内控等组分。反应条件包括扩增温度、时间、周期数和荧光信号阈值等参数。
需要注意的是:需严格按照使用说明中的参数进行设置。随意更改数值可能会影响检测结果的准确性。
part.03结果解释
fam通道:检测支原体荧光信号。
hex通道:检测内控对照荧光信号。
需要注意的是:支原体dna和内控dna存在信号的竞争性抑制。支原体dna越多,fam通道信号越高,检测内控对照的hex通道信号越低。
定量需基于ct值和dna标准曲线。
ct<40为阳性结果。ct≥40为阴性结果。

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